রাজ্যাধীন বিশ্ববিদ্যালয়গুলি প্রাদেশিক বা রাজ্যের আইন দ্বারা নির্মীত হয়। ইউজিসি এর আইন অনুযায়ী যে সব রাজ্যাধীন বিশ্ববিদ্যালয়গুলি ১৭ই জুন, ১৯৭২ এর পরে প্রতিষ্ঠিত হয়েছে, তারা কমিশনের অনুমতি ব্যতীত কেন্দ্রীয় সরকার, ইউজিসি বা সরকারি অনুদান প্রাপ্ত কোনো প্রতিষ্ঠান থেকে কোনরকম অনুদান নিতে পারবেনা। ২৫১ টি রাজ্যাধীন বিশ্ববিদ্যালয়ের মধ্যে, ইউজিসি শুধুমাত্র ১২৩ টি বিশ্ববিদ্যালয়ের জন্য সরকারি অনুদান ধার্য্য করেছে, যার থেকে বাদ পড়েছে বেশ কিছু নাকি দামী স্বাস্থ্য ও কৃষি বিশ্ববিদ্যালয় ও। তবে বাকি রাজ্যাধীন বিশ্ববিদ্যালয়গুলির (কৃষি ও প্রযুক্তি বিশ্ববিদ্যালয়) জন্য বিশেষ অনুদানের ব্যবস্থা রাখা হয়েছে। যদিও প্রায় সবকটা রাজ্যাধীন বিশ্ববিদ্যালয়ের জন্য অনুদানের ব্যবস্থা করাই এখন রাজ্য সরকারের প্রধান লক্ষ্য, কারণ একমাত্র অনুদানের মাধ্যমেই বিশ্ববিদ্যালয়গুলির পরিকাঠামোকে আরও মুজবুত করা সম্ভব।
